dnes je 7.7.2025

Input:

Když stát nestihne včas doměřit daň: Může vám úřední šnečí tempo zachránit miliony?

4.7.2025, , Zdroj: Verlag Dashöfer

Co se stane, když finanční úřad nestihne včas dokončit daňovou kontrolu? Můžete přijít o možnost snížit si daň, nebo naopak stát už nemá šanci vám ji zvýšit? Nejvyšší správní soud konečně rozsekl, jak to je s během lhůt a prodlužováním daňových řízení. Zjistěte, proč je načasování v daňových sporech klíčové!

Text vychází z judikátu č. 4670/2025 Sb. NSS, Rozšířený senát: kontrolní postupy; běh prekluzivní lhůty pro stanovení daně
(Podle usnesení rozšířeného senátu Nejvyššího správního soudu ze dne 5. 2. 2025, čj. 1 Afs 231/2022-44)

O co v judikátu šlo

Tento judikát řeší, co se děje, když finanční úřad nestihne ve stanovené lhůtě dokončit daňovou kontrolu nebo řízení k odstranění pochybností - konkrétně, zda může po uplynutí tzv. prekluzivní lhůty (nejčastěji 10 let) ještě stanovit daň. Rozšířený senát Nejvyššího správního soudu rozhodl, že po uplynutí této lhůty už daň stanovit nelze. To má obrovský dopad na jistotu daňových subjektů i na možnosti státu doměřovat daně zpětně.

Konec nekonečných kontrol

Pokud správce daně nestihne včas formálně ukončit kontrolu a vydat rozhodnutí, už nemá šanci daň doměřit. Kontrolní postupy, které neskončí včas, se „vypaří“, jako by nikdy nezačaly. To znamená, že stát už nemůže daň zpětně vyměřit a daňový subjekt má jistotu, že mu žádný nový nedoplatek nevznikne.

Možnost podat dodatečné přiznání na poslední chvíli

Judikát řeší i situaci, kdy daňový subjekt podá těsně před koncem lhůty dodatečné daňové přiznání na nižší daň. V takovém případě se lhůta pro stanovení daně prodlužuje o jeden rok. Správce daně má tedy ještě rok na prověření a případné vydání rozhodnutí, ale už nesmí stanovit vyšší daň, než byla naposledy uznána.

Praktické dopady pro podnikatele a firmy

Pro podnikatele to znamená, že čas opravdu hraje roli - pokud finanční úřad nestihne reagovat včas, už nemá šanci daně měnit. Zároveň je možné na poslední chvíli snížit svou daňovou povinnost, ale i zde má stát ještě rok na prověření. Na druhou stranu, pokud úřad nestihne včas rozhodnout, podnikatel už žádné riziko doměření nenese.

Jaká je cesta k nápravě po prekluzi

Pokud stát nestihne včas stanovit daň a vznikne vám tím škoda (například vám nebyl uznán přeplatek), nemůžete už řešit věc v daňovém řízení, ale můžete žádat náhradu škody podle zákona č. 82/1998 Sb. To je ale úplně jiné řízení a je potřeba postupovat podle pravidel pro náhradu škody způsobené státem.

Zmeškání lhůty může znamenat ztrátu peněz i možnosti obrany!

V daňových sporech je běh lhůt naprosto klíčový. Pokud správce daně nestihne včas ukončit kontrolní postup a vydat rozhodnutí, daň už vám nemůže doměřit - ale stejně tak už ani vy nemůžete snížit svou daňovou povinnost. Riziko spočívá v tom, že přehlédnutí konce prekluzivní lhůty může znamenat definitivní uzavření celé věci, a to i v případech, kdy byste mohli mít na snížení daně nárok.

Pro podnikatele a firmy to znamená, že musí pečlivě sledovat, kdy jim končí lhůta pro stanovení daně podle zákona č. 280/2009 Sb. Pokud ji propásnou, nejenže už stát nemůže daň zvyšovat, ale vy už ani nemůžete uplatnit případné přeplatky nebo snížení daňové povinnosti.

Dalším rizikem je, že pokud podáte dodatečné daňové přiznání na nižší daň těsně před koncem lhůty, stát má ještě rok na to, aby vše prověřil. Pokud v této prodloužené lhůtě zjistí nesrovnalosti, může vám sice daň snížit, ale už ji nesmí zvýšit nad poslední známou výši.

Pokud finanční úřad zmešká

Dasi - digitální asistent
Dasi
Nahrávám...
Nahrávám...